Le Dr Ernst van Hoek a travaillé au ministère de la Défense (1970-2005) néerlandais. Au cours de sa carrière, il s'est spécialisé dans la science et la technologie, et la coopération internationale. Après des études de physique nucléaire à l'Université VU d'Amsterdam, il rejoint LEOK, le Laboratoire de développement électronique pour les forces armées. Grâce à LEOK, il a rejoint l' "Improved Hawk Guided Missile System" de l'OTAN. Entre 1976 et 1985, il est détaché au bureau de gestion Hawk de l'OTAN près de Paris, d'abord en tant qu'expert en missiles, puis en tant que chef de la division industrielle.
En 1985, il retourne au ministère de la Défense à la Direction de la recherche scientifique et du développement (DWOO). En 1989, il y est nommé directeur. Ernst van Hoek était actif dans la coopération en matière de R&D au sein de l'OTAN et de l'Europe (IEPG, plus tard WEAG). En tant que président du Groupe de recherche sur la défense de l'OTAN, il a joué un rôle déterminant dans la mise en place du RTO de l'OTAN (plus tard STO).
En 1997, il est devenu le premier directeur de l'Agence de l'OTAN pour la recherche et la technologie (RTA) à Neuilly, en France. En 2000, il a repris son ancien poste au ministère de la Défense des Pays-Bas. Lorsque les Pays-Bas ont dû assurer la présidence du GAEO (qui fait partie de l'UEO) de 2002 à 2005, Ernst van Hoek a été nommé à ce poste. Par la suite, Ernst van Hoek a représenté le TNO à Bruxelles et a conseillé le NIDV pendant plusieurs années. Il est membre d'Eurodefense Nederland depuis 2001.